乙脑灭活疫苗一共注射两次，间隔7-10天，一般第二年加强注射一次，连续三次加强后不必再注射，可获得较持久的免疫力。乙脑灭活疫苗接种对象是六个月至十岁的儿童，或者是从非流行地区进入流行地区的人员。
疫苗接种应该在流行前一个月完成，接种时不能与伤寒三联杆菌疫苗同时注射，以免引起过敏反应，有中枢神经系统疾病和慢性酒精中毒者不能接种。该疫苗价格比较低廉，不良反应少，抗体保护率高，保护力一般可达60%-90%。