对于有先天性心脏畸形的患儿，及时正确的手术治疗有助于预防脑脓肿。脑膜炎和败血症患儿早期，足量使用抗生素控制感染，避免细菌经血流扩散，有助于预防脑脓肿。
（1）积极治疗感染性疾病，如中耳炎、乳突炎、脓毒血症、疖肿等。
（2）积极治疗原发疾病，如先天性紫绀型心脏病。
（3）当孩子出现发热、头痛等不适时需要及时就诊，以免耽误病情。
（4）注意保护儿童日常活动安全，避免磕碰引起头部开放性外伤。