肺炎的鉴别诊断有好多种，常见的有肺结核、肺部肿瘤、非感染性肺间质性疾病、肺水肿、肺不张、肺栓塞、肺嗜酸性粒细胞侵润症、肺支气管炎以及血管炎等。由于肺炎常见的是由细茵引起的细菌性肺炎，通常发生以一侧肺叶为主，所以在结核早期侵润时也可以出现一侧肺叶炎症，要通过胸片和痰查结核菌进行鉴别。
肺部肿瘤常见的是不明原因的一侧肺叶炎症而长期咳嗽，经过抗菌药物治疗不见好转。引起阻塞性肺炎时可以通过胸片或者支气管镜检查确诊是肺癌，还是肺炎。一些非感染性间质性疾病，如间质纤维化、肺功能损害。可以通过查体可以听到Veclo啰音，能可以区别是肺炎，还是间质纤维化，通过肺功能检测也能够区别出来。
肺不张可以通过胸片，肺栓塞可以做D-二聚体进行区别。而肺嗜酸性粒细胞浸润症进行区别时主要是采取支气管肺灌洗，通过灌洗液中可以做细胞分离，嗜酸性粒细胞增高时可以区别是肺炎，还是浸润症。支气管炎患者就是长期咳嗽、咳痰，胸片也可以发现肺纹理紊乱，所以可以进行鉴别。