腹胀先要除外器质性的疾病导致腹胀，如胃部的炎症性病变、急慢性胃炎，以及胃溃疡、肿瘤性病变，如胃癌，还有肝胆胰系统的疾病，以及肠道的疾病，都可以引发腹胀。
在除外了器质性的疾病之后，需要考虑功能性的消化不良以及功能性腹胀，这类疾病都是因为胃十二指肠，以及肠道功能紊乱引起的症状，是临床上很常见的功能性胃肠病。病因和发病机制尚不清楚，可能与胃肠动力障碍、内脏感觉过敏，以及胃对食物的容受性舒张功能下降，还有精神和社会因素有关。它的治疗主要是缓解症状，提高患者的生活质量为目的，可以给予患者促进胃肠动力，以及帮助消化的药物。有些患者上述治疗欠佳，而伴随精神症状明显者，可以试用抗抑郁的药物治疗。