1、体格检查：医生通过问诊明确患者有无饮生水，吃未洗蔬菜瓜果的习惯。通过视诊检查患者的一般状态，有无消瘦，面色异常，胸部有无异常隆起，肝脏部位有无肿大。听诊胸部呼吸音有无异常，心脏有无心包摩擦音，有无心律失常。
2、实验室检查：多数患者的血常规可见周围白细胞总数和分类正常，合并细菌感染时白细胞总数和中性粒细胞比例增高，慢性患者有轻度贫血。溶组织内阿米巴感染时，病程超过1周者，检测血清抗体敏感性约为65％，但抗体阳性的患者可为既往感染。在非流行区出现阳性反应高度支持阿米巴病诊断，而在流行区则血清学阴性更具临床价值，即提示可排除阿米巴病诊断。患者进行痰液培养可见阿米巴病原虫，有助于明确诊断。
3、影像学检查：主要进行胸部X线检查，可以看到胸部病灶的具体位置、范围、程度，有无周围部位侵及。有无胸腔积液或气胸的表现，对于下一步的治疗有一定帮助。