药物流产和无痛人流各有优缺点，药物流产没有手术的并发症，同时没有子宫内膜的创伤，成功率基本上都在90%以上，对生育力的保护是比较不错的。但是药物流产有一定药物流产失败或者药流不全的可能性，需要再次清宫，有些合并症比如肾上腺疾病、青光眼、哮喘、带环怀孕等，这些情况是不能做药物流产的，同时药物流产之后，阴道出血时间要稍微长些。
人工流产的优点在于手术时间比较短，手术后的出血时间要比较短，但是无痛人流有一定的手术并发症的可能性，比如手术当中出血、子宫穿孔、脏器损伤、人流综合征等，术后可能会对子宫内膜会有损伤，导致宫腔粘连就会导致闭经，甚至永久丧失生育能力。人流之后，如果造成感染会导致盆腔炎、输卵管积水、日后不孕或者宫外孕的可能性。