乙脑疫苗分成两种疫苗，分为灭活疫苗和减毒疫苗，理论上减毒疫苗有可能引起乙脑，具体如下：
第一、灭活疫苗，灭活疫苗是已经把乙脑细胞已经杀死了，通过蛋白质的反应激发人体对乙脑的反应免疫力。乙脑灭活疫苗可能会反映各种各样的过敏，毕竟是一种异体蛋白，可以造成比如皮疹、皮麻疹、发烧、过敏性休克等一系列过敏反应。
第二、减毒疫苗是活性疫苗，具有一定的侵袭性，但是毒力比较弱，大部分人有充分的抵抗力，对病毒进行控制反应，跟减毒疫苗、灭活疫苗一样，过敏反应要多一些。
对于某些孩子，比如免疫缺陷的孩子，艾滋病病人或者本身正在患其它传染病的孩子，接种乙脑疫苗之后因为病毒呈活性，有可能感染疫苗中真正的乙脑病毒，因此理论上减毒疫苗有可能引起乙脑。