由于急性全自主神经失调症病因尚未清楚，目前仍缺乏病因治疗，临床主要遵循早期、积极对症治疗和营养支持治疗。
一、一般治疗
急性自主神经危象发作时应进行对症处理，如及时导尿、肠外营养、静脉补充维生素等均有促进功能恢复的明显效果。
二、药物治疗
1、排尿不畅可用卡巴胆碱，皮下注射。
2、瞳孔扩大、对光反应迟钝可用醋甲胆碱滴眼。
3、直立性低血压可用泼尼松。
4、无汗或少汗、口干可用毛果芸香碱等。
5、病情严重者应用免疫球蛋白静脉注射，治疗效果显著。
6、可合并使用维生素B1、维生素B12等肌内注射，或甲钴胺片口服。
三、手术治疗
该病多无需进行手术治疗。
四、中医治疗
针灸治疗：可以选择正规的的医院进行针灸治疗，对疾病的恢复以及预后有医典的辅助作用。
五、其他治疗
1、导尿术：如果患者出现无法正常排尿，可以去医院进行插导尿管，辅助排尿。
2、肠外营养：如果患者存在肠梗阻，可以在医生的指导下进行肠外营养补充，以维持患者生命若需的营养。