丛集性头痛偏头疼可以用非甾体的抗炎药，以及麦角胺咖啡因、舒马普坦来进行治疗，也可以应用心得安和抗癫痫药物来做预防的治疗。
但是，在这里要澄清两个概念，一个是丛集性头痛，另一个是偏头痛。丛集性头痛又称作组胺性头痛，是由于组胺的代谢障碍，还有其他未知的因素引起，在一段时间内丛集性发作非常剧烈的一类头痛。但是丛集性头痛还有两个比较特殊的治疗方法，首先是吸氧治疗，在短时间内接受高浓度氧疗，效果比较好。还有就是部分患者对于皮质激素比较敏感，可以在急性期应用小剂量的皮质激素进行治疗。