小檗碱一般不用于治疗前列腺炎，小檗碱是一种生物碱，该成分主要具有消炎杀菌的作用，小檗碱目前已经制成了中成药黄连素片，这种药主要具有清热燥湿、行气止痛、止泻止痢等作用，故在临床上主要用于肠炎、痢疾等疾病。从以上功效和主治可以看出，小檗碱主要治疗肠道感染性疾病，对于前列腺疾病，包括前列腺炎，并不是其主要的主治范围。
前列腺炎可以分为急性细菌性前列腺炎和慢性前列腺炎，对于急性细菌性前列腺炎，主要使用抗生素足程、足量治疗。对于慢性前列腺炎，则主张综合治疗，包括口服药物及物理治疗等。