大疱性角膜病变一般需要长期间歇性治疗，主要通过药物及手术进行治疗，药物治疗包括左氧氟沙星、噻吗洛尔、布林佐胺等，而穿透角膜内皮移植术是治疗本病的首选手术治疗方法，患者应根据自身情况进行相应诊治。
一、药物治疗
1、左氧氟沙星：该药为抗生素，主要有消炎的作用，可以缓解畏光、流泪的症状。
2、噻吗洛尔：为β肾上腺素能阻滞剂，此类药物的作用是抑制房水产生，其降压效果有限，长期使用后降眼压效果减弱。
3、布林佐胺：为碳酸酐酶抑制剂，此类药物的作用是减少房水产生，多作为局部用药的补充。
4、甘露醇：为高渗脱水药物，此类药物可以在短期内提高血浆渗透压，使眼组织特别是玻璃体中的水分进入血液，从而迅速降低眼压。
二、手术治疗
1、穿透角膜内皮移植术：是治疗本病的首选手术治疗方法，此方法能将角膜病变大部分切除，代之以包括角膜细胞的正常组织。
2、角膜层间羊膜植入术：进行羊膜移植术可以起到屏障的作用，可以促进大疱的吸收，适应症为视功能受到严重影响、病情顽固的患者。
三、其他治疗
接触镜配戴后可吸收角膜水分，使大泡减少甚至消失。此外，还可隔绝眼睑与角膜大泡的磨擦，并消除由于大泡破裂而产生的一系列症状。