1、咽部检查：咽部检查以手指触诊为主，可观察扁桃体的大致情况，可触及扁桃体内的结石，有助于疾病的诊断。
2、探针检查：当扁桃体结石暴露在隐窝表面时，可以通过探针检查来确定疾病，主要是可以触及到硬物，以及会出现沙沙声。
3、X线检查：对于较深部的结石，手指触诊不易触及，需要借助X线及CT检查，可显示扁桃体区高密度影，可明确显示扁桃体处有结石存在，部分可显示结石的大小等。
4、CT检查：扁桃体结石在CT上多表现为扁桃体隐窝或实质内的斑点状、小圆形或卵圆形高密度影，CT值多在120 Hu以上。