性冷淡的发病原因复杂多样，包括器质性、功能性、药源性等多种因素，与患者的个性特点、生活经历、应激事件、心理社会因素等均有一定关系。
1、伴侣关系：与伴侣关系失和而产生的厌恶、反感的负性情绪，婚外性行为造成的疏离或负罪感等。
2、个体因素：自身有不正确的性观念，长期负性生活事件及沉重的压力造成持续疲劳。
3、疾病因素：如高乳素血症对男性性欲会产生显著的影响，睾酮低于关键阈值会影响男性性欲，高于关键阈值对男性性欲几乎无影响；糖尿病、甲状腺功能失调可能是女性性冷淡的风险因素。另外，抑郁症等精神疾病，也与性冷淡的发病有一定关系。
4、其他：
（1）文化或宗教因素。
（2）酗酒、吸毒者可导致性冷淡。
（3）滥用某种药物，影响内分泌水平，如抗焦虑、抗精神病制剂。