小儿急性感染性心内膜炎的病理改变是心瓣膜心内膜还有大血管内膜面，瓣膜闭锁缘处会出现感染性的赘生物。赘生物质地松软，容易脱落。脱落后容易引起身体的某些器官出现梗死或者多发性小脓肿，肝脏，肾脏，心脏，脾脏都有可能会受此影响。严重的情况下，也有可能会出现心脏瓣膜出现溃疡和穿孔的病理改变，也可能有腱索断裂，可发生急性心瓣膜关闭不全。