妊娠合并外阴阴道念珠菌病最好选局部治疗，选择对胎儿无害的阴道用药，但妊娠合并外阴阴道念珠菌病容易复发要注意消除诱因并积极治疗，患者的治疗周期一般为3~7天。
一、一般治疗
1、消除诱因：了解存在的诱因并及时消除，如妊娠期糖尿病及妊娠合并糖尿病时要予以控制血糖。使用棉质内裤，患者的毛巾、内裤等衣物要隔离洗涤，用开水烫，以免传播。
2、改变阴道酸碱度：念珠菌在pH5.5～6.5环境下最适宜生长繁殖，因此可改变阴道酸碱度造成不利于其生长的环境。方法是用碱性溶液如2％～4％碳酸氢钠溶液坐浴。
二、药物治疗
妊娠期可选用的阴道局部抗真菌药主要包括克霉唑、制霉菌素和咪康唑。
1、克霉唑栓剂：可抑制念珠菌细胞的麦角甾醇生物合成而起杀菌作用。
2、咪康唑栓：不仅能干扰膜的生物合成，破坏真菌的膜系统，并能抑制核糖核酸合成，阻止菌体细胞发育。
3、制霉菌素片：作用于真菌膜的胆固醇部分，与其结合，改变其渗透性，破坏菌体。
4、乳酸杆菌生物制剂：妊娠合并外阴阴道念珠菌病阴道菌群的特征是白色念珠菌显著增多，棒状杆菌、杆菌、葡萄球菌增多，乳酸杆菌明显减少。乳酸杆菌对白色念珠菌有无抑制或杀灭作用仍在探讨中，但能肯定的是乳酸杆菌可以帮助恢复抗真菌治疗后阴道的菌群失调，减少复发。
三、手术治疗
妊娠合并外阴阴道念珠菌病无法手术治疗。