一般而言，室间隔缺损是最常见的先天性心脏病之一，治疗效果好，预后也较好。手术的预后除了与疾病的病种有关系以外，还与疾病的病情有关，病情的轻重与否决定了患者预后的结果。另外，还与治疗的时机有关，如果能够及时治疗，远期和正常人没有差别。如果错过了最佳手术的机会，则远期有一定的影响。
手术的预后还与是否有合并症有关，如果术后存在残留的解剖问题，则远期也有可能有一定的影响。总而言之，先天性心脏病，包括室间隔缺损在内，手术后都需要定期进行复查，应积极关注和管理健康。