巧克力囊肿一般多久会复发，没有确定的时间段，这与患者的个人体质，疾病的严重程度，年龄都有关。通常情况下，如果年龄小于40岁，术后可能会在2~3年内有复发的可能性。如果大于45岁，复发的可能性降低。预防巧囊的复发，可以口服短效避孕药6个月。如果有生育需求的，巧囊术后尽早怀孕，怀孕可以延缓子宫内膜异位囊肿的复发。