谷胺转肽酶偏高的原因众多，最常见的是生理性的原因，如大量的酗酒以及使用药物，都可能引起谷氨酰转肽酶的升高，谷氨酰转肽酶存在于肝脏、肾脏、胰腺、肺、脑、心肌、骨骼肌等组织中。
肝内主要是存在肝细胞以及胆管上皮中，所以当出现肝脏的病变时，谷氨酰转氨酶容易引起升高。另外见于胆道梗阻性的疾病，如胆道结石、胆管癌，还有病毒性的肝炎、肝硬化、肝纤维化、酒精肝、药物肝以及肝癌、胆管癌，都有可能升高。此外其他脏器的疾病，也可能引起谷氨酰转肽酶的升高，需要进一步的详细检查，才能确认其具体的原因。