头皮一阵阵的疼痛，可能是皮肤和皮下软组织的炎症，或者是神经痛，具体如下：
1、皮肤和皮下软组织的炎症：多数由细菌感染引起，仔细检查头皮，可能会发现皮肤和皮下的红肿病灶。
2、神经痛：前半部分的头皮归三叉神经管辖，后半部分的头皮归神经管辖，当这两根神经受到病毒感染，或者是供血不足的影响时，就会出现神经纤维脱髓鞘，而产生神经电生理短路，引起头皮一阵阵的疼痛。