1、肛门指检：主要检查肛管及直肠下端有无肿块、异物，同时可以判断肛门门]收缩力情况。
2、蹲位用力排便检查：患者在蹲位时做用力排便的动作，常常可使直肠脱垂。若仍不能证实，可让患者在出现脱垂时拍照，帮助诊断。
3、肛门直肠镜检查：可在直视下观察直肠末端有无直肠脱垂、黏膜松弛以及有无出血、糜烂、溃疡、充血等情况。
4、结肠镜检查：结肠镜检查主要判断结肠内是否有肿瘤，同时可以取少许组织进行病理检查。
5、磁共振成像(MRI)排粪造影及X线排粪造影：如果体格检查时未能再现脱垂，或症状提示其他盆底疾病，造影检查(功能显像)会有所帮助。采用传统透视或动态MRI进行排粪造影，可在高达80%有排便梗阻症状的患者中发现与直肠脱垂有关的异常，同时可以显示是否合并子宫脱垂及膀胱脱垂等并发疾病，以指导盆底功能重建手术。
6、肛管直肠压力测定：主要评估肛门括约肌功能，直肠脱垂患者肛管静息压、收缩压均较正常人低，该检查也用于手术后治疗效果评估。
7、妇科检查及尿道动力学检查：该检查可评估同时合并子宫脱垂及膀胱脱垂的情况。
8、结肠传输试验：该试验用来排除结肠慢传输型便秘。