脑干梗塞的典型症状，包括眩晕、呕吐、复视、肢体交叉性瘫痪，或偏瘫、四肢瘫等等，部分患者可出现眼睑下垂，一侧或两侧瞳孔扩大，眼球不同轴，可出现水平或垂直性眼征，同侧肢体共济失调，患者有部分可能会出现闭锁综合征。
如果脑干梗塞面积较大，则可能出现意识障碍、针尖样瞳孔、四肢瘫痪、呼吸障碍、去大脑强直、应激性溃疡、中枢性高热等等表现。患者如脑干梗塞面积大，则可能会引起脑疝形成，常可能迅速死亡。