肝内钙化灶并不存在自愈的说法，主要是肝内钙化灶本身它就是属于一些钙质的沉积，类似于肝脏炎症损伤后的疤痕，所以这种情况下本身就是不需要特殊处理的，也就不存在自愈的方法。如果是想让肝内钙化灶消失，是比较困难的，它就类似于肝脏本身的疤痕，是一些疤痕后的反应。
除非是肝内钙化灶是其他的一些病因导致的，针对病因进行切除，可能才能够给予消失。比如说因为一些肝内的错构瘤会引起钙化，肝内的寄生虫钙化，或者肝内的良恶性肿瘤合并钙化，或者说是因为一些肝内胆管结石误认为钙化，这些情况下给予积极的治疗，包括手术切除，就有可能让其消失。