眼球穿孔伤的治疗需要根据损伤程度决定治疗方式，所有患者需进行抗破伤风和预防性抗炎治疗，伤口小于3mm者选择保守治疗，大于3mm者选择手术治疗。多数患者的治疗周期为4周左右。
一、保守治疗
适于伤口小于3mm者，首先进行伤口清洁，给予局部及全身抗生素治疗，进行眼部绷带轻压包扎封闭伤口，一般1～2天后伤口闭合。
二、药物治疗
1、破伤风抗毒素：所有患者均需用精制破伤风抗毒素皮下注射(先皮试)，以预防破伤风。
2、糖皮质激素：适于合并重症感染者，多用于术后辅助治疗。有强大的抗炎、抗免疫、抗敏作用，可短期应用，能快速缓解过敏症状。常见副作用包括脂代谢异常、内分泌紊乱、骨质疏松等。
3、抗生素：适于伤口不洁者，可局部应用于眼球抗感染，若感染症状较重需全身用药。先使用广谱抗生素，根据细菌培养结果更换敏感抗生素。
三、手术治疗
缝合手术：适于伤口大于3mm者，或伤口内有眼组织嵌顿，在伤后6小时内进行眼组织还纳，进行伤口清洁和缝合，缝合后进行巩膜的电凝止血。