小孩为过敏性咳嗽的病因并不是十分明确。日本曾经报道真菌定植可以作为变应原引起过敏性，抗真菌治疗是有效的，其他的国家和地区并没有真菌相关性咳嗽的相关临床报道，所以是否是由于真菌定植引起的过敏性可尚待于证实。
此外，一些诱发因素，可以导致孩子出现过敏性咳嗽，比如说油烟、香烟、烟雾、灰尘、冷空气以及长时间讲话等因素都可能会诱发过敏性咳嗽。所以，孩子出现过敏性咳嗽的病因不是十分清楚。