阴囊湿疹通常不会自愈，相反如果不及时治疗，可能会导致阴囊湿疹出现加重。阴囊湿疹具体原因尚不明确，其基本原因可能与免疫功能异常、系统性疾病、皮肤屏障功能受损有关。
另外，神经精神因素比如紧张、焦虑、烦躁；个人因素比如穿着不透气的内裤、嗜酒；生活环境因素，比如生活于潮湿的环境，喜欢使用碱性洗涤剂等；刺激因素比如过度搔抓、反复摩擦；遗传因素也可能参与其中。正是由于阴囊湿疹原因不详，所以治愈比较困难。临床治疗可以选择外用弱效糖皮质激素霜剂，常见的比如丁酸氢化可的松乳膏等，还可以选择外用钙调磷酸酶抑制剂，常见的比如他克莫司软膏等。