肥厚性心肌病是导致青少年猝死的常见原因，治疗的目的在于改善症状，预防并发症，减少猝死的发生。治疗的原则是减轻左心室流出道梗阻，延缓心肌肥厚的发生，减慢心率，积极的治疗心律失常。首先要注意休息，避免情绪激动和剧烈的运动，不能够参加竞技性的运动。口服β受体阻滞剂，减慢心率，降低心肌收缩力，增加心肌的顺应性，从而减轻流出道的梗阻，达到改善症状的目的。对于严重的病例，可以考虑外科手术或者是乙醇消融，心脏移植手术是治疗无效后的最后选择。