食欲减退的原因最常见的是消化系统疾病，消化系统负责消化、吸收，有很多器官，包括胃、小肠、结肠、肝、胆、胰的脏器。这些脏器任何一个器官出现了问题都会导致食欲减退，其中比较常见的是胃部疾病，如胃炎、胃溃疡、胃部的肿瘤等。
这一类疾病会影响到胃的蠕动以及消化食物的功能，患者会出现食欲减退。此外，肝脏、胆囊、胰腺都很大程度上参与了食物的消化作用。这三个脏器出现了疾病也会导致食欲减退，如慢性肝炎、胆囊炎以及胰腺炎、胰腺肿瘤等，因此需要到医院完善检查才能明确病因。