自然流产肚子疼的厉害，要及时到正规医院就诊。自然流产指的是非人为原因发生的流产，出现明显的腹痛，有以下两种可能。1、可能是流产不全，可能有胚胎组织嵌顿在宫颈口刺激子宫收缩，引起腹痛，可以通过妇检和B超发现。需要及时清宫处理。2、有可能是自然流产后感染，大多会伴有阴道分泌物的增多及异味，检查时会有明显的宫颈抬举痛及宫体压痛或者附件区压痛，炎症指标会明显升高，需要取宫颈分泌物查病原体以及药物敏感试验，根据结果选择抗菌素治疗。