小儿流感病毒肺炎以病毒感染为主要诱因，所以抗病毒治疗是本病的主要治疗方式，同时加强锻炼，提高免疫力也至关重要。
一、药物治疗
1、抗病毒药物：
（1）奥司他韦：奥司他韦具有抗病毒的作用，主要适用于成人和1岁以及1岁以上儿童流感治疗。
（2）利巴韦林：利巴韦林是一种广谱抗病毒药，适合于呼吸道病毒引起的病毒性肺炎，此药最主要的毒性是溶血性贫血。
2、抗生素：
（1）青霉素：青霉素抗菌作用强，是小儿流感病毒继发细菌肺炎的首选药。但青霉素过敏者禁用，容易诱发过敏性休克。
（2）阿莫西林：阿莫西林是一种全身抗感染药物，主要作用于敏感的细菌，患者使用后可能会有恶心、呕吐、腹泻等不良反应。
3、镇咳祛痰药：
（1）盐酸氨溴索：适用于伴有痰液分泌不正常及排痰功能不良的急性、慢性肺部疾病，可能会出现接触性皮炎和胃肠道反应，过敏者禁用。
4、解热镇痛药：
（1）布洛芬悬混液：布洛芬混悬液为解热镇痛类非处方药，少数病人使用该药后可出现恶心、呕吐、胃烧灼感或轻度消化不良，支气管哮喘、肝肾功能不全、凝血功能障碍者慎用。
5、平喘药：适用于出现明显喘息的患儿，可使呼吸恢复通畅，主要药物有氨茶碱、沙丁胺醇吸入剂等。
二、物理治疗
物理治疗：恢复期可用红外线照射、超短波治疗等物理疗法促进肺部炎症吸收。
三、其他治疗
物理降温：用于高热患者，毛巾浸入温水后拧干，擦拭患者颈部、腋窝、胸部、腹股沟，以达到蒸发降温的目的，控制体温。