女性假两性畸形最有效的治疗方式是手术治疗，应根据患者原社会性别、本人愿望及畸形程度予以矫治，可以结合药物治疗，提高治疗效果。
一、药物治疗
可的松类药物：以抑制垂体促肾上腺皮质激素的过量分泌和防止外阴进一步男性化及骨骺提前闭合。还可促进女性生殖器官发育和月经来潮，甚至有受孕和分娩的可能。
二、手术治疗
1、阴蒂缩小整形手术：如果阴蒂比较肥大，要及早做阴蒂缩小整形手术，把肥大的阴蒂切除，只保留阴蒂头，然后把阴蒂整形成正常的阴蒂大小。
2、阴道口增宽术：如果阴道口狭窄，需要做阴道口增宽术，主要把阴道口切开，将其扩大，再把阴唇瓣插入到阴道口当中，修复创面。