自身免疫性甲状腺疾病是一组以产生自身甲状腺抗体，和淋巴细胞浸润甲状腺为特征的器官特异性自身免疫疾病，是T细胞介导的器官特异性自身免疫紊乱。自身免疫性甲状腺疾病主要包括毒性弥漫性甲状腺肿，也叫Graves病，还有Graves眼病、慢性淋巴细胞性甲状腺炎、产后甲状腺炎，以甲状腺实质的淋巴细胞浸润作为主要特征，遗传倾向和环境因素的互相作用是导致自身免疫性甲状腺疾病发生的关键因素。基因的因素在出现甲状腺过氧化物酶抗体和甲状腺球蛋白抗体升高的人当中作用非常的明显。
在自身免疫性甲状腺疾病当中，基因因素占70%-80%的比例，而环境因素占20%-30%。其中环境因素主要包括感染、生活的压力、碘的摄取、吸烟、药物、放射线的暴露、环境的毒物，其中射线和碘的摄取、环境毒物与自身免疫性甲状腺疾病的发生、发展相关，如果碘摄入过多会增加自身免疫性甲状腺疾病发病和对功能的影响。自身免疫性甲状腺疾病的治疗针对功能异常的治疗，如果功能减退引起的甲减，使用左甲状腺激素替代治疗。如果功能过高，如果是Graves病，通过抗甲状腺的药物、手术、同位素治疗。如果是慢性淋巴细胞性甲状腺炎引起一过性甲状腺激素毒血症，需要对症治疗。