附件巧克力囊肿属于子宫内膜异位症的一种临床表现，当子宫内膜组织出现在附件区域，尤其是卵巢的部位，就被称为巧克力囊肿，卵巢是最容易被异位内膜侵犯的器官，约80%的病变累及一侧附件组织。异位的内膜侵犯卵巢的皮质，并在其内生长，反复周期性出血，形成单个或多个囊肿的典型病变，称为卵巢巧克力囊肿，两种大小不一，直径都在5厘米左右，呈暗褐色，如同巧克力一样，所以被称作巧克力囊肿。