穿透性心脏损伤的病因比较明确，基本都是由于各种事故直接或者间接造成心脏组织或者心血管部位损伤，受损的程度与不同的病因也有一定相关。
1、高速异物所致的损伤：高速异物通常指枪弹、弹片、尖刀等高速锐利的异物穿透胸壁伤及心包、心脏所致。这在战时尤为多见，平时也常见到。这类损伤常与胸部、腹部外伤同时存在，是穿透性心脏损伤最常见的原因。
2、胸骨或肋骨骨折：断端猛烈向内移位穿透心脏引起的损伤多是由交通事故或工业事故所致。
3、其他原因所致的穿透性心脏损伤：心导管检查、介入性心脏治疗、心包穿刺及食道异物等均可造成心脏穿透伤。偶见肋骨固定钢针移位造成心脏损伤。