头颅磁共振检查含有平扫和很多功能成像。和头颅CT成像原理不一样，平扫显示脑组织结构清晰，特别是颅底成像伪影少。功能成像常用的有DWI，显示急性梗死明显优势，PWI成像和DWI成像比较分析缺血半暗带，SWI成像对脑出血诊断有优势，还有在不用药的条件下可以动脉血管成像(MRA)和静脉血管成像(MRV)，增强磁共振和波谱分析，有利于颅内肿瘤的诊断。