在临床上，有一部分肾病二期的患者能够治好，但是大多数肾病二期的病人的病情会迁延不愈，甚至有的人会出现肾功能进行性减退等等。肾病二期一般理解为慢性肾脏病二期，慢性肾脏病是根据病人估算的肾小球滤过率来进行判断。通常病人肾小球滤过率在60-90mL/min之间，如果病人合并有血尿、蛋白尿，或者是肾脏其它的形态和功能改变，算是慢性肾脏病二期，这个时候病人的肾功能基本上还能够维持。
肾病二期治疗的关键主要是针对病人的病因进行治疗，要看血尿、蛋白尿的原因，找到原因以后，决定是给病人用ACEI还是ARB，还是用激素免疫抑制剂等等，经过积极的治疗，有一部分病人可以治愈。