有明确病因的非独立性鼻中隔穿孔者，首先治疗病因。而单纯鼻中隔穿孔者，首先行全身和局部抗感染治疗，再择期行穿孔修补术。
一、药物治疗
1、局部用药：可使用百多邦以及络合碘抗炎消毒。
2、全身用药：可以口服阿莫西林胶囊进行抗感染治疗。
二、手术治疗
单纯鼻中隔穿孔者，首先行全身和局部抗感染治疗，再择期行穿孔修补术。根据穿孔位置、大小选择修补方式和修补材料，主要方法有鼻中隔黏膜骨膜减张缝合法、带蒂黏骨膜瓣或黏膜瓣转移缝合法、游离组织片移植法、硅橡胶片植入法等。