碳酸钙和柠檬酸钙在来源、药物代谢、副作用，以及药品价格方面都有所区别，碳酸钙属于无机钙，一般来自于贝类、虾、蟹、牡蛎为代表的海洋生物或者各种动物的骨骼。天然的柠檬酸钙在植物果实中含量丰富，由于碳酸钙来源更容易，因此价格更便宜。碳酸钙含钙量高，因此每天的摄入量要比柠檬酸钙少，患者容易接受。但柠檬酸钙的吸收率和溶解性都比碳酸钙高，而且吸收和胃酸水平没有太大的关系。而碳酸钙的吸收和胃酸有很大关系，只能在饭后才能服用。如果胃溃疡患者正在服用抑制胃酸的药物，此时选择柠檬酸钙更好一些。从不良反应上看，碳酸钙会引起消化不良、胀气等副作用，柠檬酸钙则有可能带来便秘、头疼等不良反应。