福克斯-阜太斯病的药物治疗多采用醋酸泼尼松龙、0.1%维A酸乳膏、己烯雌酚、异维A酸等。当患者患处严重瘙痒，局部和系统治疗反应差时，可采用局部切除或电灼术，激光疗法和浅层X线放射治疗也奏效。
一、药物治疗
1、局部用药：
（1）醋酸泼尼松龙：此药物为中效能糖皮质激素，具有良好的抗炎、止痒、调节免疫、抗过敏的作用。对于此病的疗效较好。糖尿病患者慎用、妊娠期慎用。对本品及甾体激素类药物过敏者禁用，不可长期大量大范围使用，单独几个皮损可进行皮损内注射使用。
（2）0.1%维A酸乳膏：具有调节上皮细胞及其他细胞的生长与分化的作用，可用于此病，具有一定的治疗效果。孕妇及备孕期禁用。
（3）克林霉素：外用可以改善患者的症状和体征，但疗效比较慢。
（4）钙调磷酸酶抑制剂：阻断T淋巴细胞内炎症因子的合成与释放，表现出强的抗炎活性，不会导致皮肤萎缩。
2、系统用药：
（1）己烯雌酚：是人工合成的非甾体雌激素物质，能产生与天然雌二醇相同的所有药理与治疗作用。妊娠期间、哺乳期妇女、已知或怀疑患有雌激素依赖肿瘤、急性血栓性静脉炎或血栓栓塞、未明确诊断的阴道不规则流血禁用。此药也可用女性口服避孕药代替，剂量及用法按避孕的方法使用即可。
（2）异维A酸：具有调节上皮细胞及其他细胞的生长与分化的作用。8周后减为半量维持，皮损完全消退，但停药3个月后复发。故皮损消退后应小剂量维持治疗。对本品任何成分过敏者、孕妇或即将妊娠的妇女、哺乳期妇女、肝肾功能不全、维生素A过量患者禁用。用药三个月内禁止怀孕。
二、手术治疗
1、手术切除：局部麻醉下，对患处进行彻底的切除，适用于严重瘙痒，局部和系统治疗反应差的患者。
2、电灼术：利用特殊器械，将电能转化为热能，使患处组织坏死，等待新皮肤重新生长，以达到重新治疗的目的，适用于药物治疗无效的患者。
三、物理治疗
1、浅层X线放射治疗：适用于严重瘙痒，局部和系统治疗反应差的患者，所用的照射量以不应引起皮肤反应为准。一般多采用小剂量分次照射，表层X线治疗照射总量不应超过0.39C(1500R)。
2、剥脱性点阵激光：利用激光将患处组织杀死，等待患处重新生长，以达到治疗的目的，临床较少采用。
四、其他治疗
注射A型肉毒素：此疗法见效，疗效可维持3~6个月，但临床还较少使用。