流行性脑脊髓膜炎要根据分型选择合适的治疗，主要是药物治疗，治疗原则是早诊断、早干预，治疗周期一般为一周左右。
一、一般治疗
退热：高热时可用酒精擦浴，安乃近滴鼻或小剂量安乃近肌内注射。头痛可酌情用可待因、阿司匹林，或用高渗葡萄糖液静注。惊厥时可用副醛肌注或用10％水合氯醛灌肠，镇静剂剂量不宜过大，以免影响病情的观察。
二、急症治疗
1、抗休克治疗：暴发型流行性脑脊髓膜炎会出现休克，抗休克治疗关键在于扩充血容量及纠正酸中毒，及合理应用血管活性药物。
2、抗弥散性血管内凝血(DIC)治疗：若休克经综合治疗后不见好转，出血点即使未见增加，也应考虑有DIC存在，应作有关凝血及纤溶的检查，并开始肝素治疗。若皮肤瘀点不断增多，且有融合成瘀斑的趋势，不论有无休克，均可应用肝素，目前采用低分子量肝素。
3、呼吸衰竭的处理：暴发型脑膜脑炎出现呼吸衰竭，须加强脱水治疗，给予吸氧、吸痰、头部降温以防治脑水肿、防止脑疝及呼吸衰竭的发生。如已发生，可给予洛贝林、尼可刹米、二甲弗林、哌甲酯等呼吸中枢兴奋剂。大剂量山莨菪碱静注可改善微循环，减轻脑水肿，肾上腺皮质激素也有降低颅内压的作用，疗程不宜超过3日。高热和频繁惊厥者可用亚冬眠疗法。呼吸停止时应立即做气管插管或气管切开，进行间歇正压呼吸。
三、药物治疗
1、青霉素：青霉素的脑脊液浓度一般为血浓度的10％~30％，因此必须投予较大剂量才能达到治疗作用，但注意过大剂量可致青霉素脑病，不能误为病情加重。也可选用氨苄西林，透入脑脊液中的浓度会更高。
2、头孢菌素类：第一代头孢菌素因不易透过血脑屏障，故不宜应用。第三代头孢菌素如头孢噻肟和头孢曲松疗效良好。这类药物毒性低，抗菌谱广，且脑脊液内浓度较高。
3、磺胺类：由于我国流行的A群菌株对磺胺类药大多敏感，成人宜采用复方磺胺甲恶唑针剂或片剂，亦可采用磺胺嘧啶，同时补等量硫酸氢钠及足量水分。有肝、肾功能损害、对磺胺类药过敏者均不宜使用。
4、强心药及肾上腺皮质激素：暴发型患者易出现感染性休克，除了扩容应及时给予强心药及肾上腺皮质激素，短期大剂量应用可有效缓解症状。
5、脱水剂：对于暴发型脑膜脑炎多有脑水肿应及时用脱水剂，脱水剂的应用以20％甘露醇为主，宜至呼吸、血压恢复正常，瞳孔等大及其他颅内高压症状好转为止。脱水时应适当补充液体、钾盐等，以保持轻度脱水状态为宜。甘露醇可与呋塞米合用，亦可与50％葡萄糖液交替使用。
四、手术治疗
该疾病通常无需手术手术治疗。