乳头乳晕角化过度症尚无特效治疗，可试用0.05%~0.1%维A酸软膏或角质剥脱剂。有报道用卡泊三醇软膏治疗有效，依据患者的同意可进行局部的手术切除。此外，激光疗法及冷冻治疗对于较小的皮损也具有一定的作用。
一、药物治疗
1、0.05%~0.1%维A酸软膏：具有调节上皮细胞及其他细胞的生长与分化的作用，疗效不确切，可试用于此病，可减少鳞屑的生成，孕妇及备孕期禁用。
2、水杨酸乳膏：为角质剥脱剂，水杨酸具有抗炎、促进微循环、去除老化的角质的功能，外用于患处，对此病可能具有一定的效果。适用于用于头癣、足癣及局部角质增生的患者，对本品过敏者及皮肤破溃者慎用。
3、卡泊三醇软膏：为皮肤外用药，适用于寻常型银屑病(牛皮癣)，用于此病的鱼鳞型。对本品过敏者、钙代谢失调患者以及有维生素D中毒症状者禁用。此外，本品禁与水杨酸制剂合用。
二、手术治疗
手术切除：外科切除患处是此病的首选治疗方法。如病变只局限于乳头，为累及乳晕及乳房者，可进行单纯的乳头的完整切除。如病变累及乳晕，应切开乳房进行手术探查，可对患处做稍微过大的切除，术后可去专科的美容科室进行硅胶填充及移皮。此病很少累及到乳房的内部，如累及可进行整个乳房的切除，恢复后患者可以选择人工乳房重建。但是此病的患者一般都较为拒绝手术治疗，应注意给患者多做思想沟通。
三、物理治疗
1、激光疗法：常使用强度较大的二氧化碳激光，进行对患处的切除及杀死病变组织，以起到治疗的作用，但是不适用于较大的皮损的患者。
2、液氮冷冻治疗：将患处的病变组织在短时间内快速冻死，等待痂皮脱落、正常皮肤重新生长出来，以达到治疗的目的，对于此病具有一定的效果，适用于较小的皮肤损害。