小儿便血的病因较多，必须结合病史，发病年龄，临床症状及必要的实验室检查，和胃十二指肠镜，直肠指检等相关辅助检查。常见的原因主要为消化道疾病，还有全身性疾病。消化道疾病常见的有食管静脉曲张，消化性溃疡，出血性坏死性肠炎，回肠远端憩室出血，肠套叠，肠扭转，或肠重复畸形，肠系膜血管栓塞，消化道血管瘤及其他肿瘤，痢疾，肠伤寒，肠结核，直肠或结肠息肉及痔及肛裂。全身性疾病包括血小板减少性紫癜，过敏性紫癜，再生障碍性贫血，各型白血病等。