目前临床考虑支原体引起的尿道炎的治疗，首选的药物是阿奇霉素1克，单剂口服，其次是多西环素或喹诺酮类的莫西沙星。因为阿奇霉素临床上很快出现耐药，所以阿奇霉素的疗程也可以延长（最初每天500mg，随后250mg，持续4天）。莫西沙星的方案是每天400mg，7天，10天或14天。如果临床考虑支原体引起的盆腔炎，临床多给予莫西沙星每天400mg，持续14天方案。