马拉色菌毛囊炎的并发症有花斑癣、脂溢性皮炎等。
1、花斑癣：花斑癣是马拉色菌侵犯皮肤角质层引起的表浅感染，皮损初为以毛孔为中心，边界清楚的点状斑疹，可为褐色、淡褐色、淡红色、淡黄色或白色，逐渐增大至指甲盖大小，圆形或类圆形，邻近皮损可相互融合成不规则大片状，表面覆以糠秕状鳞屑，偶有轻度瘙痒。
2、脂溢性皮炎：好发于皮脂溢出部位，以头、面、胸及背部等处多见。躯干部皮损散发，相邻者融合形成多环形或地图状等，上覆有油腻性鳞屑，有时轻度渗出。