肾囊肿经过锻炼以后不会消失，出现了题目所说的情况很可能是肾囊肿过小，直径小于0.5cm，第一次检查的时候采用的影像学检查项目，精确度比较大，也就是经过肾脏CT扫描发现肾脏的小的囊肿。第二次检查的时候很可能采用的分辨率比较粗略的B超来进行的检查，当小的囊肿在B超上比较隐匿，检查的人员没有仔细看，或者这个人比较肥胖，经脂肪或者肌肉的超声波不能很好的显示小的囊肿，有可能不会发现囊肿，并不是消失而是没有发现。
如果想确认囊肿是否有变化，是否增长、是否稳定不变，需要前后经过同一种检测方式来进行检测，而不是每一次选择不同的检测方式。因为每一种不同的检测方式都存在敏感度，也就是分辨率，不同分辨率的检测方式不能进行严格的对比。