没有恶性甲状腺炎，甲状腺炎最常见的像亚急性甲状腺炎，是和病毒感染相关的自限性疾病，主要表现是发热、颈部痛性的包块。随着休息或者医生帮助使用合理的药物，病程往往两个月左右，很少超过半年，都能够完全愈合，很少遗留甲状腺功能减退。另外，最常见的桥本甲状腺炎，是自身免疫性甲状腺炎的一种，随着病情的进展，可以出现甲状腺功能减退。
如果出现甲减，是由于自身免疫损伤造成甲状腺组织的破坏，也不会变成恶性，只需要进行甲状腺激素替代治疗，病情能够明显得到控制，患者寿命、生活质量都能够有保障。另外，像无痛性甲状腺炎或者产后甲状腺炎，患者可能会出现一过性的甲状腺功能损伤，但是也不会变成恶性甲状腺炎。