临床上很多的HPV感染有自愈的可能，因为大多数HPV感染为一过性，HPV感染也是比较常见的一种类型。临床自愈的前提是身体的免疫状况良好、生殖道的微生态环境正常，而且在感染期治疗期间没有夫妻间的交叉感染，在这种前提下HPV高危阳性有一部分可以自愈。
通常情况下HPV感染是比较漫长的过程，感染的平均潜伏期是三个月，最长八个月。在治疗的阶段防止交叉感染是最基本的方式，夫妻同房应该采用男性的避孕套来阻断交叉感染。统计表明，有20%左右的女性在感染高危型HPV后会临床自愈。