颅内生殖细胞肿瘤病程较长，需要进行长期间歇性治疗，具体可通过氢氯噻嗪、甘露醇、甘油果糖等药物降低颅内压，同时配合手术加放疗、化疗等方式进行改善。
一、药物治疗
本病可采用降颅压药物治疗，常用药物有氢氯噻嗪、甘露醇、甘油果糖、高渗盐水等。作用主要是降低颅内压，缓解患者头晕、头痛、呕吐等症状。
二、手术治疗
1、神经手术应仅限于以下几种情况：：
（1）不能明确诊断需要进行活检；
（2）占位效应危及生命；
（3）继发脑积水必须行对症手术；
（4）高度怀疑畸胎瘤或经放化疗后残余病变较大考虑畸胎瘤成分为主。
2、具体手术方式如下：：
（1）内镜下三脑室底造瘘术：在治疗梗阻性脑积水可行的情况下，此术式优于其他外科手术。继发性脑积水时，首选内镜下三脑室底造瘘术。
（2）临时分流手术：继发性脑积水时，可配合临时分流手术。
（3）脑室-腹腔分流术：脑室-腹腔分流术比其他类型的分流术有更高的肿瘤转移率和更短的平均生存时间。
三、放射治疗
利用放射性杀灭肿瘤，对于大部分的颅内生殖细胞肿瘤应首先考虑放疗，如有残存灶可行挽救性手术。更推荐放疗联合化疗的综合治疗，在降低不良反应的同时，能提供治愈率。不良反应为乏力、骨髓抑制、局部脱发、皮肤色素沉着甚至脱皮。
四、化学药物治疗
以铂类药物为主的化疗药物降低了放射剂量的同时提高了患者的远期生存质量，且并未带来生存率的下降。顺铂、卡铂、博来霉素等，常用的化疗方案一般以铂类为基础，2~3种药联合治疗。如CE(卡铂、依托泊苷)、ICE(异环磷酰胺、卡铂、依托泊苷)、PE(顺铂、依托泊苷)等。不良反应为治疗期间可能会出现食欲下降、恶心、呕吐、脱发、体重下降，白细胞下降、贫血等。根据患者身体状况，对症处理。