透析后头痛的原因，最常见的是透析失衡综合征。另外，透析期间的高血压也会导致患者出现透析后头痛。对于透析的患者来说，透析后头痛最常见的就是失衡综合征。这是因为透析过程中，血液中的毒素被清除出去，但是由于人体存在血-脑屏障，这时脑部的毒素的浓度还是比较高，渗透压已经高过了血浆，这样就导致体内的水分向脑部汇集，导致患者颅内压升高，出现头痛。这时，一般会要求患者把透析的效率降低，预防患者出现透析肾病综合征。
透析导致头痛的第二个原因，就是高血压。高血压可能见于回血以后导致高血压，也可能与透析脱水以后导致RAS激活有一定关系。这时，尽量把患者的血压控制下来，也可以预防透析后的高血压，缓解头痛。