肾囊肿5cm的处理方法有以下几个：
1、如果是在健康体检中发现肾脏囊肿在5cm，又不伴有明显的临床症状，可以观察为主，每三月到半年做一次超声，观察其囊肿的增长情况。因为肾囊肿是肾脏最常见的良性肿瘤，随着年龄的增长会逐渐增大，临床指南超过5cm以上可以做治疗，但对于体检发现没有临床症状的也可以观察。
2、一旦发现肾囊肿5cm，并伴有明显的腰痛、血尿，以及反复的尿路感染等，可以进行介入治疗，包括超声引导下的穿刺引流及介入科的穿刺引流治疗，使囊液尽快排出。