在宫颈柱状上皮向鳞状上皮化生的过程中，化生上皮围绕表面柱状上皮绒毛间的裂口，而不是完全取代所有的柱状上皮，并且填满柱状上皮绒毛的间隙，形成了腺体开口，粘液是由深部残留的柱状上皮分泌并且通过开口排到表面的。表面的化生上皮会使裂口闭塞，残留的柱状上皮分泌的粘液被困在底部，形成了宫颈囊肿。宫颈囊肿是生理过程，一般不需要处理，需要定期筛查宫颈癌筛查。